Jde o umělý kanál, který dal vystavět Josef Štěpánek Netolický v letech 1506 - 1520.
Byl vybudován společně s celou rybniční soustavou Třeboňské pánve pro napájení celé řady rybníků: Káňov, Tisý, Koclířov, Záblatský, Ponědrážský a Horusický.
Odbočuje z Lužnice nad jezem Pilař na ř.km 115,9 a na ř.km 77,1 nad Veselím nad Lužnicí se do ní vrací.
Délka celého toku je téměř 47 km, osazení kilometrovníků je provedeno po proudu. V současné době není plavba po Zlaté stoce povolena.

Čas smazal stopy zásahu lidí do tvářnosti krajiny, takže Zlatá stoka dnes působí zcela přirozeně, i když někdy plyne v korytě nasypaném nad úrovní terénu. Proud je mírný, stejnoměrný, plavbu znepříjemňuje množství nízkých mostků, lávek a křoviny, kterými je zarostlý poslední úsek.